蛇類的身體表面佈滿了鱗片。盲蛇的鱗片，都是大小一致的圓鱗；其它蛇類的腹鱗，要比身體兩側的鱗片和背部的鱗片大，腹部的顏色也比其它部位的顏色淺。蛇的體色和花紋也非常豐富多彩，蟒蛇的顏色非常美麗，紅棕色的底色，而且越往背部下半身的顏色越深，越耀眼；一般的紋帶蛇，身上都有一條或幾條鮮黃色的長帶，牠的名字就是因此得來的；青竹蛇不僅體色透綠，體側還有一條由背鱗綴成的、紅白各半的縱線，美麗極了；珊瑚蛇身上有紅、黃、紫藍連成的連環花紋；天堂蛇身上的花紋，精細而美麗；更有名如其「蛇」的錦蛇，身上好像穿了一件錦緞的繡袍，光彩眩目。不過，水蛇就沒那麼好看了，牠的鱗片較粗糙，而且沒有一點光澤。金環蛇的身上有鮮艷的黃、黑相間的環紋，因此臺灣稱牠為雨傘蛇，廣東稱牠為金腳帶。銀環蛇的身上有黑白相間的環紋，所以人們稱牠為銀腳帶。
每一條蛇，在牠生長的過程中，都需要脫皮。脫皮以前，蛇身體的花紋會變得暗淡無光，眼睛蒙上一層白色的薄膜，而且這段時間蛇不吃也不喝，這種情形要持續幾天到二週的時間。然後，蛇的眼睛又清澈了，變得虎虎有生氣起來，牠開始到處爬動。碰到較硬的物體，就用嘴部去摩擦，很快，蛇身上的舊皮就從嘴部開始龜裂，最後掉下來。脫掉的舊皮，是無色的，但還是有原來蛇皮紋路的特徵。脫掉了舊皮，蛇換上一層閃亮的新皮膚，光線一照，還會有灼灼的發光。蛇剛褪完皮後，會立刻去找食物和水。
骨 骼蛇的全身有兩百到四百塊脊椎骨，蛇的椎骨上除了有前後互相連接的普通關節外，還有一副椎弓凸和椎弓凹，椎弓凸和椎弓凹相互扣合成為一個關節，這樣前後椎骨就連接得更加緊密了。這種構造只有蛇和蜥蜴類動物有，其它的動物是沒有的。
每一塊背椎骨都連接著一對肋骨，用手摸一下自己的胸口，硬硬的就是胸骨，就是胸骨把肋骨連接起來。但是蛇卻沒有胸骨，所以牠的肋骨都是分開的，這樣牠可以吞下比牠的身體還粗的獵物，而不會脹破。但是，沒有胸骨也給蛇造成了一個很致命的弱點；捕蛇人往往抓住蛇的尾巴，輕輕一抖，蛇的椎骨就會脫臼，很快便一命鳴呼了！
蛇類頭部的骨骼結構也十分特殊，牠的下顎與頭蓋骨相連的部位，有一塊方骨。方骨和下顎骨、頭蓋骨之間，又有像橡皮帶一樣的韌帶，能夠伸縮自如。在動物中，蛇類的這種頭部結構是獨一無二的，可以使蛇的口張得很大。
腺 液毒蛇的毒腺長在上顎，有輸送管可迅速的輸送毒液。每種毒蛇毒液的毒性都各有不同。眼鏡蛇毒液含有神經毒，會破壞神經系統，使獵物癱瘓。蝮蛇的毒液含有壞血毒，會影響血液，造成心臟衰竭。噴毒蛇的毒液，能使獵物全身麻痹、眼睛失明，甚至死亡。毒蛇自身的膽汁能分解自身的毒液，所以牠吃了被自己咬死的獵物也不會被毒死。毒蛇如果被同種類毒蛇咬傷，因為牠本身對這種毒素具有抗毒性，所以在短暫昏迷後，又會甦醒過來；如果被不同種毒蛇咬傷，也一樣會中毒。但像眼鏡蛇這種毒性很強的毒蛇，如果被同種類蛇咬傷，也會被毒死。除了毒液以外，蛇還會分泌大量唾液，幫助吞嚥和消化食物。
水蛇有一個滿裝液體的肛門腺，這種液體有一種怪味，會讓許多人覺得頭暈。不過水蛇並不輕易噴出這種液體，除非牠的牙齒已經不能應付對手了。